Ορισμένες περιβαλλοντικές οργανώσεις και πολέμιοι της αιολικής ενέργειας παρουσιάζουν τις ανεμογεννήτριες ως εξολοθρευτές πτηνών που αφανίζουν τους πληθυσμούς τους.
Ωστόσο μια πρόσφατη έρευνα έρχεται να αναδείξει μια νέα πτυχή σε αυτή τη διαμάχη. Διευρυμένη έρευνα του Αμερικανικού Ινστιτούτου Άγριων Πτηνών (AWWI) υποστηρίζει ότι οι ανεμογεννήτριες προκαλούν από 214.000 ως 368.000 θανάτους πτηνών κάθε χρόνο. Παρότι τα νούμερα δεν είναι καθόλου αμελητέα, πόσω μάλλον όταν σε πολλές περιπτώσεις πρόκειται για πουλιά που κινδυνεύουν με εξαφάνιση, είναι πάντως χαμηλά σε σύγκριση με τους 6,8 εκατομμύρια θανάτους που προκαλούνται από συγκρούσεις πουλιών με κεραίες ραδιοφώνου και κινητής τηλεφωνίας.
Οι ερευνητές εστίασαν τη μελέτη τους σε μικρά πτηνά της τάξης των στρουθιόμορφων (ή πασσερίνες) και τα ευρήματά τους έδειξαν ότι ποσοστό μόλις 0,01% εξ αυτών συγκρούεται με ανεμογεννήτριες. Υπολογίζεται ότι οι γάτες των πόλεων καταφέρουν πολύ μεγαλύτερο χτύπημα στους πληθυσμούς των πουλιών με 1,4 ως 3,7 εκατομμύρια θανάτους κάθε χρόνο.
Την ίδια ώρα, η οργάνωση προστασίας των πτηνών National Audubon Society δημοσίευσε στοιχεία που δείχνουν ότι τα πουλιά της Αμερικής σε ποσοστό άνω του 50% κινδυνεύουν από την κλιματική αλλαγή, ένα εύρημα που καθιστά την αιολική ενέργεια -ως τεχνολογία ηλεκτροπαραγωγής μηδενικών ρύπων- όχι πολέμιο αλλά μάλλον σύμμαχο των πουλιών.
Παραμένει βέβαια αναπάντητο το ερώτημα σχετικά με τις επιπτώσεις των ανεμογεννητριών στα μεγαλύτερα πουλιά όπως οι αετοί, τα γεράκια και άλλοι θηρευτές. Επίκειται έρευνα και για αυτά τα πουλιά από το AWWI.
Το μόνο βέβαιο είναι ότι από τους κινδύνους που αντιμετωπίζουν τα πουλιά στις μέρες μας, οι ανεμογεννήτριες δεν βρίσκονται στην κορυφή της λίστας σε αντίθεση με την Κλιματική Αλλαγή
